Родился в 1530 году в Каневе в семье простого казака.
После смерти в 1564 году гетьмана Вишневецкого Самойлол Кошка был выбран сначала кошевым атаманом, а затем и гетьманом.
Двадцать шесть лет он провел в плену у турок прикованным к галерам. После побега из плена в 1602 году убит в национально-освободительной войне с поляками.
Будучи избран гетманом, добился от польского короля Сигизмунда III Вазы отмены баниции (закона о признании казаков вне закона), что привело к признанию казачества как общественного состояния. В 1600 году возглавлял запорожцев в общем казацко-польском походе в Крым. В 1601-1602 годах Кошка во главе 4-тысячного казацкого отряда участвовал в поьско-шведсклй войне в Ливонии.
О дальнейшей деятельности Кошки и обстоятельства смерти достоверных данных нет. Одни исследователи считают, что Кошка погиб 28 февраля 1602 года во время Инфляндского войны в бою под Феллини (возле города Полтсамаау, Ливонии) и был перевезен и похоронен в Каневе. Новым гетманом, вместо Самийла Кошки, казаки избрали Гавриила Ерутневича.
По другой версии гетман Кошка еще принимал участие в Цецарской битве 1620 года, умер в 1620 году и похоронен в Каневе, чему свидетельством служит его гроб, находящийся в этом городе.
Но, следует учитывать, что тогда бы Кошке должно было быть около 90 лет.